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 | Acceso al texto completo restringido a Biblioteca INIA Las Brujas. Por información adicional contacte bibliolb@inia.org.uy. |
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
25/09/2016 |
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Actualizado : |
09/10/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
ARRUABARRENA, A.; BENITEZ-GALEANO, M.J.; GIAMBIASI, M.; BERTALMIO, A.; COLINA, R.; HERNÁNDEZ-RODRÍGUEZ, L. |
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Afiliación : |
ANA ARRUABARRENA PASCOVICH, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARÍA JOSÉ BENÍTEZ-GALEANO, Laboratorio de Virología Molecular, Centro Universitario Regional Noroeste (CENUR Noroeste), Universidad de la República; MARIO ALEJANDRO GIAMBIASI RODRIGUEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ANA MARIA BERTALMIO CASARIEGO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; RODNEY COLINA, Laboratorio de Virología Molecular, Centro Universitario Regional Noroeste (CENUR Noroeste), Universidad de la República; LESTER HERNÁNDEZ-RODRÍGUEZ, Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical, La Habana, Cuba. |
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Título : |
Application of a simple and affordable protocol for isolating plant total nucleic acids for RNA and DNA virus detection. |
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Fecha de publicación : |
2016 |
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Fuente / Imprenta : |
Journal of Virological Methods, 2016, v.237, p. 14-17. |
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DOI : |
10.1016/j.jviromet.2016.08.011 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: Received 30 May 2016 / Received in revised form 26 July 2016 / Accepted 14 August 2016 / Available online 16 August 2016. |
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Contenido : |
ABSTRACT.
Standard molecular methods for plant virus diagnosis require the purification of RNA or DNA extracts from a large number of samples, with sufficient concentration and quality for their use in PCR, RT-PCR, or qPCR analysis. Most methods are laborious and use either hazardous and/or costly chemicals.Apreviously published protocol for RNA isolation from several plant species yields high amounts of good quality RNADNA mixture in a simple, safe and inexpensive manner. In the present work, this method was tested to obtain RNA-DNA extracts from leaves of tomato, potato and three species of citrus, and was compared with two commercial kits. The results demonstrated that this protocol offers at least comparable nucleic
acid quality, quantity and purity to those provided by commercial phenol-based or spin column systems and that are suitable to be used in PCR, RT-PCR and qPCR for virus and viroid detection. Because of its easy implementation and the use of safe and inexpensive reagents, it can be easily implemented to work in plant virus and viroid detection in different plant species.
© 2016 Elsevier B.V. All rights reserved |
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Palabras claves : |
DNA; PCR; PLANT VIROID; PLANT VIRUS; PURIFICATION; RNA; RT-PCR. |
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Thesagro : |
CITRUS. |
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Asunto categoría : |
-- |
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Marc : |
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Biblioteca
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Identificación
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Origen
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Tipo / Formato
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Clasificación
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Cutter
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Registro
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Volumen
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Estado
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha actual : |
22/05/2023 |
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Actualizado : |
22/05/2023 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Nacionales |
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Circulación / Nivel : |
Nacional - -- |
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Autor : |
ETCHEVERS, I.; IRIARTE, M.V.; MARQUES, L.; FERENCZI, A.; DALLA RIZZA, M.; MARZAROLI, J.; SARAVIA, A.; FRESIA, P. |
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Afiliación : |
ISMAEL ETCHEVERS, Independent researcher, Rocha, Uruguay; MARÍA VICTORIA IRIARTE, Ministerio de Ganadería, Agricultura y Pesca (MGAP), Dirección General de Servicios Ganaderos (DGSG), Montevideo, Uruguay; LAURA MARQUES, Ministerio de Ganadería, Agricultura y Pesca (MGAP), Dirección General de Servicios Ganaderos (DGSG), Montevideo, Uruguay; ALEJANDRA FERENCZI, Ministerio de Ganadería, Agricultura y Pesca (MGAP), Dirección General de Bioseguridad e Inocuidad Alimentaria (DIGEBIA), Área de Bioseguridad, Montevideo, Uruguay; MARCO DALLA RIZZA VILARO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JORGE MARZAROLI, Advisor on public policies for rural development with an ecosystem approach, Montevideo, Uruguay; ALEJANDRO SARAVIA, Instituto Plan Agropecuario (IPA), Montevideo, Uruguay; PABLO FRESIA, Unidad Mixta UMPI, Institut Pasteur Montevideo + INIA, Montevideo, Uruguay. |
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Título : |
Review on ecological interactions of the Cochliomyia hominivorax fly and assessment of the possible impacts of its eradication in Uruguay. [Revisión de las interacciones ecológicas de la mosca Cochliomyia hominivorax y evaluación de los posibles impactos ecológicos de su erradicación en Uruguay]. [Revisão das interações ecológicas da mosca Cochliomyia hominivorax e avaliação dos possíveis impactos ecológicos de sua erradicação no Uruguai]. |
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Complemento del título : |
Review. |
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Fecha de publicación : |
2022 |
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Fuente / Imprenta : |
Agrociencia Uruguay, 2022, Vol.26, number 2, e1056. https://doi.org/10.31285/AGRO.26.1056 -- OPEN ACCESS. |
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ISSN : |
2730-5066 |
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DOI : |
10.31285/AGRO.26.1056 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: Received 12 May 2022; Accepted 19 Jul 2022; Published 16 Sep 2022. -- Correspondence: Ismael Etchevers, ismaelec@gmail.com ; Pablo Fresia,
pfresia@pasteur.edu.uy -- Editor: Milka Ferrer, Universidad de la República, Facultad de Agronomía, Montevideo, Uruguay. -- License: This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License. (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ ) |
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Contenido : |
ABSTRACT.- Controlling a pest species raises questions about the harmful effects its eradication could cause in ecosystems. Currently, in Uruguay are being analyzed strategies to eradicate the New World Screwworm (NWS), Cochliomyia hominivorax (Diptera: Calliphoridae), an obligatory ectoparasite that causes myiasis in warm-blooded vertebrates, including humans. The loss of a species implies a risk of secondary extinctions and cascading effects that depend on the ecological function of the species and the capacity of the rest of the species with which it interacts to compensate for its loss. To assess the ecological impact of the NWS eradication, we analyzed its ecological redundancy, its effect as an indirect regulatory agent for other species, and its participation in critical ecosystem functions. We conclude that the NWS presents high functional redundancy in most ecological interactions. It does not play an essential role as a regulatory agent of other species and does not play an important role in critical ecosystem functions. Without ignoring the information gaps that certainly exist about the ecological interactions network of the NWS in Uruguay, we estimate that its eradication is unlikely to cause secondary extinctions or cascading effects in the networks it integrates. In order to timely detect possible impacts during the course of the program, it is recommended to monitor the ecosystems using indicators related to direct and indirect partners in the ecological interactions of the NWS. .-.-.-.-.-.-.-.-.-.-RESUMEN.- El control de una especie plaga genera interrogantes sobre los efectos nocivos que su erradicación podría causar en los ecosistemas. Actualmente, en Uruguay se analizan estrategias para erradicar la mosca de la bichera (MB), Cochliomyia hominivorax (Diptera: Calliphoridae), un ectoparásito obligatorio que causa miasis en vertebrados de sangre caliente, incluidos los humanos. La pérdida de una especie supone un riesgo de extinciones secundarias y efectos en cascada que dependen de la función ecológica de la especie que se pierde y la capacidad del resto de las especies con las que interactúa para compensar su pérdida. Para evaluar el impacto ecológico de la erradicación de la MB analizamos su redundancia ecológica, su efecto como agente regulador indirecto de otras especies y su participación en funciones críticas de los ecosistemas. Concluimos que la MB presenta alta redundancia funcional en la mayoría de sus interacciones ecológicas, no juega un papel importante como agente regulador de otras especies y no juega un papel importante en funciones ecosistémicas críticas. Sin desconocer los vacíos de información que ciertamente existen sobre la red de interacciones ecológicas de la MB en Uruguay, estimamos que es poco probable que su erradicación cause extinciones secundarias o efectos en cascada en las redes de interacciones ecológicas que integra. A fin de detectar oportunamente eventuales impactos durante el curso del programa, se recomienda monitorear los ecosistemas utilizando indicadores relacionados con socios directos e indirectos en las interacciones ecológicas de la MB. .-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-RESUMO.- O controle de uma espécie praga levanta questões sobre os efeitos nocivos que a erradicação pode causar nos ecossistemas. Atualmente, no Uruguai estão sendo analisadas estratégias de controle para erradicar a mosca da bicheira (MB), Cochliomyia hominivorax (Diptera: Calliphoridae), um ectoparasita obrigatório que causa miíase em vertebrados de sangue quente, incluindo o homem. A perda de uma espécie implica um risco de extinções secundárias e efeitos em cascata que dependem da função ecológica da espécie que se perde e da capacidade do resto das espécies com as quais interage para compensar a sua perda. Para avaliar o impacto ecológico da erradicação da MB, analisamos sua redundância ecológica, seu efeito como agente regulador indireto para outras espécies e sua participação em funções críticas do ecossistema. Concluímos que a MB apresenta alta redundância funcional na maioria de suas interações ecológicas, não desempenha um papel importante como agente regulador de outras espécies e não desempenha um papel impor-tante em funções críticas do ecossistema. Sem ignorar as lacunas de informação que certamente existem sobre a rede de interações ecológicas do NWS no Uruguai, estimamos que é improvável que sua erradicação cause extinções secun-dárias ou efeitos em cascata nas redes de interações ecológicas que integra. Para detectar oportunamente possíveis impactos durante o curso do programa, recomendase monitorar os ecossistemas usando indicadores relacionados a parceiros diretos e indiretos nas interações ecológicas da MB. Copyright (c) 2022 Agrociencia Uruguay MenosABSTRACT.- Controlling a pest species raises questions about the harmful effects its eradication could cause in ecosystems. Currently, in Uruguay are being analyzed strategies to eradicate the New World Screwworm (NWS), Cochliomyia hominivorax (Diptera: Calliphoridae), an obligatory ectoparasite that causes myiasis in warm-blooded vertebrates, including humans. The loss of a species implies a risk of secondary extinctions and cascading effects that depend on the ecological function of the species and the capacity of the rest of the species with which it interacts to compensate for its loss. To assess the ecological impact of the NWS eradication, we analyzed its ecological redundancy, its effect as an indirect regulatory agent for other species, and its participation in critical ecosystem functions. We conclude that the NWS presents high functional redundancy in most ecological interactions. It does not play an essential role as a regulatory agent of other species and does not play an important role in critical ecosystem functions. Without ignoring the information gaps that certainly exist about the ecological interactions network of the NWS in Uruguay, we estimate that its eradication is unlikely to cause secondary extinctions or cascading effects in the networks it integrates. In order to timely detect possible impacts during the course of the program, it is recommended to monitor the ecosystems using indicators related to direct and indirect partners in the ecological inte... Presentar Todo |
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Palabras claves : |
Cochliomyia hominivorax; Ecological impact; Ecological interactions; Eradication; Erradicação; Functional redundancy; Impacto ecológico; Interacciones ecológicas; Redundancia funcional. |
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Asunto categoría : |
H10 Plagas de las plantas |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/17162/1/2730-5066-1056.pdf
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Marc : |
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500 $aArticle history: Received 12 May 2022; Accepted 19 Jul 2022; Published 16 Sep 2022. -- Correspondence: Ismael Etchevers, ismaelec@gmail.com ; Pablo Fresia, pfresia@pasteur.edu.uy -- Editor: Milka Ferrer, Universidad de la República, Facultad de Agronomía, Montevideo, Uruguay. -- License: This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License. (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ )
520 $aABSTRACT.- Controlling a pest species raises questions about the harmful effects its eradication could cause in ecosystems. Currently, in Uruguay are being analyzed strategies to eradicate the New World Screwworm (NWS), Cochliomyia hominivorax (Diptera: Calliphoridae), an obligatory ectoparasite that causes myiasis in warm-blooded vertebrates, including humans. The loss of a species implies a risk of secondary extinctions and cascading effects that depend on the ecological function of the species and the capacity of the rest of the species with which it interacts to compensate for its loss. To assess the ecological impact of the NWS eradication, we analyzed its ecological redundancy, its effect as an indirect regulatory agent for other species, and its participation in critical ecosystem functions. We conclude that the NWS presents high functional redundancy in most ecological interactions. It does not play an essential role as a regulatory agent of other species and does not play an important role in critical ecosystem functions. Without ignoring the information gaps that certainly exist about the ecological interactions network of the NWS in Uruguay, we estimate that its eradication is unlikely to cause secondary extinctions or cascading effects in the networks it integrates. In order to timely detect possible impacts during the course of the program, it is recommended to monitor the ecosystems using indicators related to direct and indirect partners in the ecological interactions of the NWS. .-.-.-.-.-.-.-.-.-.-RESUMEN.- El control de una especie plaga genera interrogantes sobre los efectos nocivos que su erradicación podría causar en los ecosistemas. Actualmente, en Uruguay se analizan estrategias para erradicar la mosca de la bichera (MB), Cochliomyia hominivorax (Diptera: Calliphoridae), un ectoparásito obligatorio que causa miasis en vertebrados de sangre caliente, incluidos los humanos. La pérdida de una especie supone un riesgo de extinciones secundarias y efectos en cascada que dependen de la función ecológica de la especie que se pierde y la capacidad del resto de las especies con las que interactúa para compensar su pérdida. Para evaluar el impacto ecológico de la erradicación de la MB analizamos su redundancia ecológica, su efecto como agente regulador indirecto de otras especies y su participación en funciones críticas de los ecosistemas. Concluimos que la MB presenta alta redundancia funcional en la mayoría de sus interacciones ecológicas, no juega un papel importante como agente regulador de otras especies y no juega un papel importante en funciones ecosistémicas críticas. Sin desconocer los vacíos de información que ciertamente existen sobre la red de interacciones ecológicas de la MB en Uruguay, estimamos que es poco probable que su erradicación cause extinciones secundarias o efectos en cascada en las redes de interacciones ecológicas que integra. A fin de detectar oportunamente eventuales impactos durante el curso del programa, se recomienda monitorear los ecosistemas utilizando indicadores relacionados con socios directos e indirectos en las interacciones ecológicas de la MB. .-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-RESUMO.- O controle de uma espécie praga levanta questões sobre os efeitos nocivos que a erradicação pode causar nos ecossistemas. Atualmente, no Uruguai estão sendo analisadas estratégias de controle para erradicar a mosca da bicheira (MB), Cochliomyia hominivorax (Diptera: Calliphoridae), um ectoparasita obrigatório que causa miíase em vertebrados de sangue quente, incluindo o homem. A perda de uma espécie implica um risco de extinções secundárias e efeitos em cascata que dependem da função ecológica da espécie que se perde e da capacidade do resto das espécies com as quais interage para compensar a sua perda. Para avaliar o impacto ecológico da erradicação da MB, analisamos sua redundância ecológica, seu efeito como agente regulador indireto para outras espécies e sua participação em funções críticas do ecossistema. Concluímos que a MB apresenta alta redundância funcional na maioria de suas interações ecológicas, não desempenha um papel importante como agente regulador de outras espécies e não desempenha um papel impor-tante em funções críticas do ecossistema. Sem ignorar as lacunas de informação que certamente existem sobre a rede de interações ecológicas do NWS no Uruguai, estimamos que é improvável que sua erradicação cause extinções secun-dárias ou efeitos em cascata nas redes de interações ecológicas que integra. Para detectar oportunamente possíveis impactos durante o curso do programa, recomendase monitorar os ecossistemas usando indicadores relacionados a parceiros diretos e indiretos nas interações ecológicas da MB. Copyright (c) 2022 Agrociencia Uruguay
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Esconder MarcPresentar Marc Completo |
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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